برخلاف خط حمله استقلال بازیکنان این تیم در خط دفاعی هنوز نتوانسته‌اند خواسته‌های مربیان را پیاده کنند. از نقطه نظر دفاعی، استقلال بازیکنان مطرحی در اختیار دارد؛ از هادی شکوری و پژمان منتظری گرفته تا حنیف عمران‌زاده و امیرحسین صادقی اما هنوز این بازیکنان اسم و رسم‌دار نتوانسته‌اند خط دفاعی استقلال را به یک خط دفاعی ایده‌آل و مد نظر مربیان تبدیل کنند. زوج‌های دفاعی در استقلال ساخته نمی‌شود و این مساله بزرگترین مشکل خط دفاعی این تیم به حساب می‌آید. برخلاف خط حمله، بازیکنان خط دفاعی استقلال همخوانی خاصی با یکدیگر ندارند و همین دلیلی شده تا خط حمله آبی‌پوشان با خط دفاعی این تیم به هیچ وجه قابل قیاس نباشد. در خط حمله و با وجود برهانی، اکبرپور، مجیدی و سیدصالحی بخش زوج‌سازی و حرکات ترکیبی به طرز قابل توجهی انجام می‌شود اما در خط دفاع و با استناد به اینکه استقلال در چند بازی هم گلی دریافت نکرده اما انجام عمل زوج‌سازی به درستی انجام نشده است. بازیکنان خط دفاعی استقلال هنوز موفق نشده‌اند درک متقابلی از بازی یکدیگر به دست آورند. تک تک مدافعان استقلال می‌توانند نعمتی برای تیم‌های دیگر باشند اما وقتی کنار هم قرار می‌گیرند از هماهنگی آنها کاسته شده و در نهایت گل‌های عجیبی وارد دروازه استقلال می‌شود. حالا باید دید با حضور نامجومطلق و البته راهکارهای مرفاوی آیا بازیکنان خط دفاعی استقلال می‌توانند این ایراد اساسی را برطرف کنند یا همچنان خط دفاعی پاشنه آشیل آبی‌پوشان به حساب می‌آید.