مجیدی برای تیم ملی 45 بازی انجام داده و موفق شده در این بازیها 10 بار گلزنی کند.
فرهاد مجیدی انصراف خود از حضور در تیم ملی را طی نامه ای به علی کفاشیان رییس فدراسیون فوتبال اعلام کرده است. در بخشی از این نامه آمده است:"با توجه به برگزاری مسابقات جام جهانی فوتبال در سال 2014 و عدم حضور احتمالی اینجانب در آن مسابقات به دلیل وضعیت سنیام و حضور جوانان توانمند، جویای نام و مستعد در سطح اول فوتبال کشور، بدینوسیله علیرغم میل باطنی از ادامه حضور در تیم ملی عذرخواهی میکنم. حضور در تیم ملی و شاگردی استادی چون کارلوس کروش افتخاری است که همیشه در زندگی ورزشیام ماندگار است.
بی شک جوانان با انگیزهای چون کریم انصارفرد، میلاد میداوودی، سید ایمان موسوی، محمد نزهتی، میلاد زنیدپور و ... از اعتبار و آبروی فوتبال ایران عزیز دفاع خواهند کرد؛ جوانانی که شاید با حضور امثال مجیدی به سرنوشت بنده حقیر در گذشته دچار شده که در عین جوانی و آمادگی فنی از حضور و خدمت در تیم ملی فوتبال محروم شدم."