فرشید باقری از زمانی که شفر به عنوان
سرمربی استقلال انتخاب شد به یک بازیکن تاثیرگذار در تیمش تبدیل شد و در
لیگ قهرمانان آسیا هم نمایش درخشانی در ترکیب استقلال داشت.
قرارداد فرشید باقری در پایان فصل به پایان رسیده است و عدم تمدید قرارداد
او با استقلال باعث شده شایعاتی در مورد جدایی او منتشر شود.
با این حال گفته می شود فرشید باقری تمایل دارد قرارداد خود را با استقلال
تمدید کند و در صورتی که خواسته های او اجرا شود، احتمالا ظرف روزهای آینده
قرارداد خود را تمدید می کند.