استقلال در طول تاریخ خود به طور رسمی 5 بار در بوشهر به میدان رفته که دو برد، یک تساوی و 2 باخت به دست آورده است. در جام حذفی سال 67 استقلال در بوشهر 3-صفر با سه گل سعید درویشی به ایرانجوان باخت، اگرچه بعدا نتیجه این بازی در کمیته انضباطی به سود استقلال تغییر کرد زیرا حضور سعید قائم مقام در ایرانجوان که از اهواز آمده بود غیر قانونی تشخیص داده شد. در لیگ قدس و در سال 68 تیم پاس بوشهر میزبان استقلال شد که آبی پوشان در این بازی 2- صفر پیروز شدند و این تنها برد استقلال در بوشهر بوده است. از اتفاقات آن دوران می‌توان به درگیری محمدرضا شکورزاده مدافع آبی‌ها با یکی از بازیکنان بوشهری اشاره کرد. این مدافع وقتی روی نیمکت نشست با حمله یک تماشاگر که از روی فنس به زمین آمده بود با پنجه بوکس از ناحیه سر مصدوم شد. در بازی بعد که استقلال به بوشهر رفت برای دوری از حاشیه مینی‌بوسی آبی رنگ بازیکنان این تیم را تا پیست کنار زمین برد. شکورزاده وقتی پیاده شد شلواری کردی به پا داشت. او با شعارهایی علیه خود روبرو شد و برای تحریک هواداران بوشهری تمام عرض زمین را مثل یک ژیمناست حرفه ای پشتک زد!
در فصل 72 لیگ دسته سوم، بازی استقلال و ایرانجوان در بوشهر یک- یک مساوی شد و در جام حذفی 83 نیز استقلال با هدایت قلعه‌نویی مقابل شاهین که محمود ابراهیم زاده هدایتش می کرد در ضربات پنالتی شکست خورد. بازی برگشت لیگ برتر نهم را هم تهرانی‌ها با تک گل رینالدو از روی نقطه پنالتی بردند. در لیگ برتر آن سال استقلال در آزادی هم 2- یک تیم یاوری را برد. این فصل در بازی رفت و در دیداری جنجالی بازهم آبی‌ها بردند و در جام حذفی هم یک- صفر در وقت‌های اضافی با گل عمران‌زاده پیروز شدند.
از دیدارهای غیررسمی هم می توان به اردوی استقلالی‌ها در جزیره خارک به دعوت شرکت نفت اشاره کرد. این اردو در سال 71 برگزارشد. استقلالی‌ها آنجا منتخب خارک را با 4 گل بردند و با لنج راهی بندر گناوه شدند تا با تیم آزادی این شهر دیدار کنند. آن بازی هم با حضور نفراتی مثل علیرضا دلیخون (قرار بود استقلالی شود اما نشد) رضا حسن زاده، مرتضی یکه، خسرو پارسا و... با دو گل به سود استقلالی‌ها خاتمه یافت. نکته جالب آن سفر شکستن لنج این تیم در خلیج فارس بود. آن روز نزدیک بود استقلالی‌ها در راه برگشت به خارک در دریا غرق شوند. مرتضی یکه در آن لحظات شده بود بمب خنده. آن روزها در استقلال جنجال کاپیتانی بود. شاهرخ بیانی و نامجو مطلق مدعیان اصلی بازوبند بودند. یکه گفته بود: «فردا که خبر مرگ ما در رسانه ها اعلام شد شاهرخ با خوشحالی بازوبند را برمی دارد اما نمی داند که مدعی اصلی بازوبند یعنی نامجو مطلق هم تهران مانده و در این سفر نبوده تا از بین برود.» عابدین عباسی ناخدای آن لنج اهل گناوه بود که بازیکنان او را ناخدا خورشید صدا می زدند. با مشکلات فراوان لنج به جزیره رسید و تیم با پرواز به تهران برگشت. حالا پنج‌شنبه استقلال به بوشهر می‌رود. پرویز مظلومی که نام واقعی‌اش پرویز مظلوم تنگستانی و از اهالی دشتی بوشهر است حالا به دیار خود بر می‌گردد. او فصل قبل با مس کرمان در بوشهر 4 گل خورد. گزارش آن شب شاهین بهرام نژاد گزارشگر بوشهری هنوز در برخی تلفن‌های همراه وجود دارد که روی گل سوم گفت «بزن عبدا... یکی از اون شوت‌های معروفت را» کرمی هم زد وگل شد تا بهرام نژاد فریاد بزند «ممنون عبدا... که به حرفم گوش دادی!»