با حکم بهرام افشارزاده، محسن خدایی که در لیگ پانزدهم نیز به عنوان مدیر اجرایی در کنار تیم فوتبال استقلال حضور داشت، برای لیگ شانزدهم نیز به عنوان مدیر اجرایی تیم فوتبال استقلال انتخاب شد.