در بحث کاپیتانی مهدی رحمتی مسائلی مطرح شد که باعث دلخوری امیر قلعه نوعی و دروازه بان آبی ها شد، به این دلیل که سرمربی تیم معتقد است نام دیگر بازیکنان در حالی به عنوان کاپیتان مطرح شده است که عاملی باشد برای ایجاد حاشیه در تیم استقلال و ایجاد مشکلاتی که این تیم را در اردو وارد حاشیه کند.
از طرفی، اعلام شده است که در بحث نقل وانتقالات نیز یک مسئول تیم در باشگاه مخالفتهایی را با امیرقلعه نوعی انجام داده است که در نهایت منجر به جدایی تیموریان، قاسم دهنوی و عدم جذب برخی بازیکنان مورد نظر این مربی شد.
گفتنی است، سرمربی استقلال در خصوص صحبتهایی با علی فتح الزاده انجام داده است تا مدیر عامل استقلال دراین موردوارد عمل شده و به مشکلات پایان دهد، و حتی اعلام شده است مهدی رحمتی از اتفاقاتی که در خصوص بحث کاپیتانی مطرح شد انتقاد کرده است و اعلام داشتند که برخی در باشگاه تمایل ندارند وی کاپیتان آبی ها باشد، و به همین دلیل ایجاد مشکل می کنند، به همین دلیل مدیریت استقلال اعلام کرده است پس از بازگشت از کشور ترکیه در این خصوص اقدامات جدی را انجام می دهد و حتی احتمال فسخ قرار داد یک مقام در باشگاه استقلال از سمت خود وجود دارد
البته این امر هنوز قطعی نشده است، اما احتمال عدم ادامه همکاری برخی مسئولین با استقلال در ادامه راه وجود دارد